Misją Muzeum Ziemi Nadnoteckiej im. Wiktora Stachowiaka jest gromadzenie i trwała ochrona dóbr naturalnego i kulturowego dziedzictwa Trzcianki i regionu nadnoteckiego – dziedzictwa o charakterze materialnym i niematerialnym. Realizując tę misję, Muzeum nie tylko gromadzi, konserwuje, przechowuje, opracowuje i udostępnia zbiory, ale gromadzi również wszelką dokumentację związaną z dziedzictwem kulturowym regionu nadnoteckiego i prowadzi w tym zakresie badania naukowe, których wyniki udostępnia w formie wystaw lub publikacji. Muzeum jest wydawcą rocznika „Kronika Ziemi Trzcianeckiej”.